שורשיה של משתלת שורשים החלו את צמיחתם עם ראשית ההתיישבות בנגב ופיתחת רפיח בשנות החמישים והשבעים של המאה הקודמת, כאשר המייסדים ומשפחותיהם הגיעו לעסוק בעבודת האדמה וקשרו את גורלם עם חבל ארץ זה. הרעיון של יוסי אביאיה מלאכי ואואקרט חנניה להפוך את משקם למשק מתמחה בייצור שתילי ירקות קרם עור וגידים.

ייצור שתילים בתבניות גידול ובמצע מנותק היה רעיון חדשני, והמעבר לגידול שתילים בשיטה זו היה מהפך בקנה מידה עולמי, אשר היה לו תפקיד מכריע בכל התהליך המואץ של התפתחות ענף הירקות והתבלינים בארץ.

ב- 1982 עם חתימת הסכם השלום עם מצרים התחילה המשתלה את פעילותה במושב עין הבשור, בייסודם של חנניה אואקרט ויוסי אביאיה מלאכי.

המושג שורשים מייצג עבורנו את הקשר והחיבור לערכים של אהבת האדמה, התיישבות והפרחת השממה כמו גם למשפחתיות. ערכים אלו מתחברים ובאים לידי ביטוי בעשייה, בתהליכי ייצור מתקדמים ובקשר בלתי אמצעי עם העוסקים בחקלאות ברחבי המדינה.